In the Name of God følger vi Theodor, en præst i en lille landsby, som får stor omtale, efter at hans hustru mirakuløst overlever en dødelig sygdom takket være hans bønner. Da miraklet bliver draget i tvivl, må han bevise over for byen, at det var Guds kraft, der reddede hende. Men det kræver, at han graver dybere i det okkulte sammen med sin ungdomsmentor, den nu pensionerede præst Jonas.